@Dana Scully 

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

@Dana Scully @Asteraceae

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

Sinon rien à voir mais ça fait 15 mn que mes collègues du bureau d'en face passent leur temps à ouvrir/fermer leur porte à clef sans interruption, ça commence à me saouler là (la porte de mon bureau est fermée mais j'entends quand même les bruits de serrure non-stop - et leurs voix respectives, c'est pas un cambriolage en cours ) 

@Allitché Ah non elles sont un jour/semaine dans mon labo mais à temps plein en général. La première va faire un jour chez nous, un jour chez nos voisins et 3 jours dans un autre labo (celui qui ferme) pendant un an puis passer en 50/50 chez nous et les voisins une fois l'autre définitivement fermé. (je sais pas comment elle fait pour pas se perdre dans son emploi du temps). Et la deuxième fait un jour/semaine chez nous et 4 dans son ancien labo pendant 3 mois pour transitionner et ensuite temps plein chez nous.

Purée, ca fait des mois (depuis septembre) que je me creuse la tete sur des resultats qui sont chelou de chez chelou et je crois que je viens de piger pourquoi ca fonctionne pas je suis      tout ca parce que j’utilise un code R de quelqu'un d'autre (qui a été donné sans trop d'explication a quelqu'un d'autre qui me l'a refilé en monde "you need input in that format" sans autre info... sauf que moi j'ai fait des analyses un peu plus compliquées, j'ai pas le meme nombre d'individus dans mon fichier original et dans mon fichier final (et ces individus changent en fonction de mes iterations ) et du coup j'ai des résultats avec des correlations au ras des pâquerettes quand je m'attendais a mini 80% ... et ca fait des mois que je fais l'autruche (et que je re-run mes analyses parce que j'ai pas confiance dans mon code et que je comprends pas comment je peux avoir un résultat final super bon avec des correlation intermédiaires a 0.2 en moyenne)

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

Bref, maintenant faut que je reflechisse a comment modifier ce code pour que ca prenne les bons individus en entrée (je crois que je vais plutot modifier mes fichiers d'entrée parce que ca me prendra moins de temps que de chercher a piger R) tout relancer, faire des plots et finir mon papier la semaine prochaine ("y a plus qu'a" comme dirait ma mere)
Bref, je maudit les gens qui commentent pas leurs code   (ou le commentent a moitié) avant de le transmettre a leurs collegues sans explication !!!!

Edit: Visiblement la moi du passé avait déja réalisé ce qui pouvait poser problème (ou juste avait pensé a une autre facon de comparer les resultats) et avait inclus une ligne de code pour créer le bon format d'un des inputs... pourquoi n'a t elle pas pensé a modifier le code R? c'est une bonne question qui m'aurait fait gagner des heures de boulot... 

@Asteraceae ah bah je venais râler que j'ai fait de la merde dans mon script. Si ça peut te rassurer, c'est normal  La plupart du temps, pour les gens qui font ce genre de modèles/calculs numériques, on le passe à débuguer, et à pas voir des trucs, sauf que tu peux t'en prendre qu'à toi-même si tes inputs sont pas de la même taille, tu perds des éléments, tu fais des erreurs d'unité, de faute de frappe, etc. etc.   (enfin sauf sur les gros codes).
Et pour ce genre d'erreurs, on dit toujours, c'est mieux de se rendre compte soi-même plutôt que le referee ou reviewer du paper

Heureusement, on est tous logé.es à la même enseigne:

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

@Allitché merci, c'est vrai que mon boulot c'est beaucoup de débugage (et en vrai surtout beaucoup de temps a formater des fichiers pour avoir le bon input pour le bon software... je bidouille en bash et awk) mais ca me frustre souvent parce que j'ai pas une solide formation en code et je pense que si j'en avais plus je serai plus efficace et en meme temps les formations je les trouve pas vraiment adaptés. Je vais pas apprendre a coder en python si je sais pas concrètement a quoi ca va me servir quoi... Mais bon j'imagine que tout le monde est frustré a un moment donné par son code et comme tu dis mieux vaut s'en rendre compte sois meme plutot que ca ne soit le R2 qui le pointe! 
(j'ai fait du R pour les stats en cours et ensuite je me suis formée un peu pendant ma these mais je fais pas des codes propres et efficaces... Je pense que si je me posais quelques jours sur mes codes je pourrais en faire des fonctions facile a utiliser mais j'ai pas le courage et pas le temps)

bref... ma to do du jour c'est de relancer (encore) tout mes jobs et de faire mes plots avec les bonnes correlations pour avoir la derniere figure de mon papier! (I can do this!)

 

@Asteraceae Je me retrouve beaucoup dans ce que tu dis. J'ai appris à coder toute seule sur le tas donc je suis toujours persuadée que mes codes sont pas efficaces et pas faits selon les "best practices". Mais je trouve pas de cours adaptés, genre soit c'est niveau grand débutant et j'en suis plus là, soit c'est hyper avancé et spécifique. Mais j'ai l'impression que beaucoup de gens qui codent dans notre domaine sont dans la même situation parce qu'on est une génération qui a appris sur le tas. Maintenant y'a des MSc en bioinf un peu partout mais y'a 10 ans ( ) quand j'étais étudiante y'avait beaucoup moins d'options. Donc au moins on est pas toutes seules.

Mes collègues me saoulent épisode 45 512

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

@Dana Scully

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

Allez, dernière relecture et j'envoie le draft du manuscrit à mon chef Il est pas vraiment fini, mais j'arrive plus à avancer donc je lui ai demandé si je pouvais lui envoyer un truc "unpolished" et il m'a dit oui donc allons-y.

Edit : ca y est j'ai refilé le bébé

 @Heran.  tu peux donc partir en WE bien mérité!
moi mon code tourne, mes outputs ont la tete que je veux, mes correlations sont élevées  :rockon: je vais terminer de tout faire tourner ce WE a la maison et lundi je plot, mercredi et jeudi je finalise et vendredi j'envoie le draft!  
@Dana Scully

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

Todo du lundiiiiii (je viens de sortir du lit c'est dur )

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

Bon lundi le labo! 
Ici y a une bonne tempete et ca souffle fort dehors (Et ca alterne entre soleil/ciel bleu et grosse pluie battante)
J'ai filé un coup de main a une collegue dans le labo (en mode paillasse) ca me fait toujours plaisir de faire ce genre de choses, je me sens utile et ca me fait rire parce que mes collegues sont au petit soin parce qu'iels savent que je suis nulle et que j'ai jamais rien fait (la elle m'a filé le truc le plus facile a gérer)

Et je viens de recevoir un amendement a mon contrat : je passe de CDD a CDI !! (bon un CDI un peu batard qui est revue tous les 2.5 ans, sous reserve de funding et qui n'est valable que tant que mon PI est la, mais ca fait plaisir! Et je m'y attendais pas du tout, il me semblait qu'il fallait attendre 3 ans apres la prise de poste (mon nouveau poste) et moi ca fait que 1 an... ) 

Je viens de me faire poser un lapin-zoom (est-ce qu'on peut dire se faire zoomer un lapin ? ), alors quand c'est à 15h c'est un peu agaçant, mais quand c'est à 8 (HUIT) heure du mat c'est au-delà (<- ceci est ma tête dans la cam). En plus j'avais le hoquet en me levant, vraiment une bonne expérience du matin, le monde m'appartient à fond c'est sûr .

@Asteraceae Super, tu gères trooooop !

@Dana Scully Alors ce chou saucisse ?

Je suis saouléeeee

partira

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

@MarieCeline 

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

@Dana Scully je vais y penser très sérieusement...  :cretin:  voire déjà réserver la session de l'an prochain dans l'agenda familial !

@Dana Scully Trop dommage pour la stagiaire, elle vous a dit pourquoi ? (La mauvaise langue en moi a envie de dire que c'est peut être le ton trop cavalier de ton collègue qui lui a fait peur )

Moi soulée aussi. On a un système de réservation des équipements parce qu'une fois que les plantes poussent, l'expérience doit être faite à 10h le 14ème jour et pas un autre moment. J'ai réservé un truc pour ma stagiaire y'a deux semaines, on va à la machine ce matin : y'a déjà des plantes dedans... Franchement je suis sympa parce que je pourrais très bien jeter tout ce bordel vu que nous avons la résa et pas l'autre, en plus on sait pas combien de temps il (forcément c'est un mec ) en a encore besoin.
Du coup c'est bien, non seulement on décale mais en plus j'ai plus rien à faire faire à ma stagiaire aujourd'hui.

Mais dites moi cette journée serait pas collectivement merdique ? @Krinekrine T'es ma lueur d'espoir .

@Asteraceae Mais trop bien pour ton contrat, j'espère que vous avez pu fêter ça hier soir ! 

Ici mi saoulée mi -   :

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.

Bref çay la fête 

Allez go déterrer une todo pour faire semblant de m'organiser 

La journée de la râlerie continue .

Seuls les utilisateurs enregistrés peuvent voir ce contenu.